Agaat is een chalcedoon met een gebande structuur. De banden lopen soms in grillige vorm. Witte banden wisselen af met grijze en (rood)bruine banden. De rode en roodbruine kleur wordt veroorzaakt door zeer kleine insluitsels van hematiet, een ijzeroxide. De grijze en bruine banden zijn poreus en worden vaak behandeld met verschillende kleuren verf. Hierdoor is er agaat in alle mogelijke kleuren. Agaat vormde, net als amethyst, vaak in geodes. Een geode is een holle ruimte in een vulkanisch gesteente, waar agaat in ontstaat tijdens afkoeling van heet water.