De reuzenpaardenstaart was een boom van maximaal twintig meter hoog. Zijn holle stam en takken waren glad en werden door zogenaamde knopen in stukken (segmenten) verdeeld. De kleine bladeren stonden in kransen om de knopen en ook de zijtakken waren op de knopen aangehecht. Om zich voort te planten maakte de plant sporen, die werden verspreid door de wind. Ook had hij een wortelstok waaruit nieuwe bomen konden groeien. Om rechtop te blijven staan in de natte moerasgrond had de boom een uitgebreid wortelstelsel.